Citation : jpb 

si tu veux le faire il faut le faire à la mano c'est à dire remplacer les fichiers css dans
lib/boostrap/dist/css/
remplace les fichiers par ceux de simplex (par exemple ou autre skin que tu veux par défaut)
themes/_skins/simplex/

bootstrap.css , bootstrap.min.css, extra.css, bootstrap.css.map <= sont les fichiers à remplacer dans lib/boostrap/dist/css/ par les fichiers du skin chois qui deviendra le "defaut"